Les débuts de l’église d’Anzin remontent aux années 1820 avec Henri Pyt puis le colporteur Joseph Thieffry.
En 1863, un petit groupe se réunit toujours et prospère sous l’égide des pasteurs Jean-Philippe Crétin et François Vincent soutenus par l’Eglise Evangélique Baptiste de Denain.
C’est en 1897, que l’église inaugure son premier lieu de culte, rue Félix Faure.
En 1906, l’église est reconnue en sa qualité d’association cultuelle apparaissant de ce fait dans le bulletin officiel du 12 novembre 1906. Elle fait partie des églises qui fonderont la Fédération des Eglises Evangéliques Baptistes du Nord (FEEBNF).
Au printemps 1954, l’église s’installe au 113 avenue Anatole France dans une ancienne auberge, servant aussi de relais de poste.
De 1952 à 1960, une collaboration avec plusieurs pasteurs de la région dont Jules Thobois, Lucien Clerc, Henri Roffidal donnera naissance à une action d’évangélisation nommée ‘Mission Salut et Guérison’ touchant des villes dépourvues d’églises évangéliques. A cette époque, toutes ces églises prospèrent et l’église d’Anzin passera alors de 30 à 130 membres.
En 1963, l’église fera l’acquisition du terrain situé derrière le bâtiment actuel.
Après une longue période assez stable, le nombre des membres de l’église s’est ensuite réduit petit à petit arrivant de nouveau à une vingtaine de personnes régulière en 2015. L’arrivée du pasteur Matthieu Lemaire en septembre 2015 et la conduite spirituelle des membres du conseil de l’église ont entrainé petit à petit de nouveau une croissance de l’église.
Plusieurs pasteurs se sont succédés depuis la création officielle de l’église en 1906 : François Vincent (jusqu’en 1910), Philémon Vincent (1910-1920), Samuel Farelly (1920-1930), Gaston Brabant (1931-1937), Georges Rousseau (1937-1949), Michel Rousseau (1949-1950), Henri Roffidal (1951-1952), Paul Rosseel (1952-1957), Albert Saut (1957-1961), Charles-Louis Rochat (1963-1968), Joseph Jouravel (1968-1971), Alain Roffidal, Jacques Roffidal et Patrick Feltiniak se succèderont de 1972 à 1980, François Luc (1980-1984), Guy Mahieu (1985-2015), Matthieu Lemaire (2015-)